After months of practice, using the software had become second nature to him.
何ヶ月もの練習の後、そのソフトの使い方は彼にとって身についていた。
身についていること、無意識にできる自動的な反応や技能
Something one does automatically without thinking because it has been practiced so much.
second natureは、secondとnatureの組み合わせから直訳的に『第二の性質』という比喩が生まれ、後天的な習慣が生まれつきの性質のようになるという意味で定着した表現
